УАЗ-3962 представляет собой дальнейшее развитие санитарного УАЗ-452А. В рамках модернизации 1985 года «санитарка» получила те же изменения, что и другие машины семейства. При этом, внешне от предшественника новую модель можно отличить лишь по отсутствию ограждения окон салона, упраздненного при модернизации. Кроме того, часть машин в ходе выпуска получила цельное окно без поворотной форточки в среднем окне по левому борту. Стоит также отметить, что в ходе модернизации не был в полной мере соблюден ГОСТ-8769-75 (внешняя светотехника) для микроавтобусов – на машинах так и не появились верхние габаритные фонари спереди и сзади.

До 2000 года УАЗы сертифицировались по малому перечню требований, в который не входили требования Правил ЕЭК ООН №52, относившиеся к маломестным автобусам. В 2001 году на базе УАЗ-3962 был разработан грузопассажирский УАЗ-39625, сразу отнесенный к специальным транспортным средствам. В 2002 году к ним же отнесли и санитарный УАЗ-3962 (обозначался как «специальное ТС – санитарный автомобиль»), но впоследствии при очередной сертификации УАЗ-3962 был отнесен к специализированным пассажирским транспортным средствам.